Нажмите "Enter", чтобы перейти к контенту

Повышенная изоляция нетуберкулезных микобактерий среди подозреваемых в туберкулезе в северо-восточной части Танзании: общественное здравоохранение и диагностические последствия для программ контроля

Increased isolation of nontuberculous mycobacteria among TB suspects in Northeastern, Tanzania: public health and diagnostic implications for control programmes
Источник: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4756402/

Не туберкулезные микобактерии (НТМ) все чаще сообщаются во всем мире, связанные с болезнями человека. Определение значения НТМ в условиях эндемического туберкулеза (ТБ) требует дискриминации НТМ от туберкулеза у подозрительных пациентов. Правильная и своевременная идентификация НТМ будет влиять как на терапию, так и на эпидемиологию заболеваний ТБ и ТБ. Настоящее исследование было направлено на определение частоты и разнообразия НТМ среди подозреваемых в туберкулезе в северо-восточной Танзании.

В период с ноября 2012 года по январь 2013 года было проведено перекрестное исследование. Из 372 больных туберкулезом было собрано семьсот сорок четыре образца мокроты. Обнаружение проводили с использованием фенотипических наборов GenoType® Mycobacterium CM / AS, секвенирования гена 16S рРНК и hsp65 для идентификации изолятов, не идентифицированных наборами Hain. Модель двоичной регрессии использовалась для анализа предикторов обнаружения NTM.

Распространенность НТМ составила 9,7% микобактериальных изолятов. Из 36 пациентов с подтвержденной инфекцией NTM 12 были ВИЧ-инфицированными ВИЧ, являющимися значительным предиктором обнаружения NTM (P <0,001). Совместная инфекция Mycobacterium tuberculosis (M. tb) была обнаружена у пяти пациентов. Двадцать восемь изолятов NTM были идентифицированы с использованием GenoType® Mycobacterium CM / AS и восемь изолятов не были идентифицированы. Выявленные виды включали M. gordonae и M. interjectum 6 (16,7%), M. intracelullare 4 (11,1%), M. avium spp. и M. fortuitum 2 (5,5%), M. kansasii, M. lentiflavum, M. simiae, M. celatum, M. marinum 1 (2,8%) каждый. Из изолятов, не отождествляемых с подвидным уровнем, мы идентифицировали M. kumamotonense (2), M. intracellulare / kansasii, M. intermedium / triplex, M. acapulcensis / flavescens, M. stomatepiae, M. colombiense и M. terrae complex (1) каждый из которых использует секвенирование 16S рРНК. Кроме того, секвенирование гена hsp65 идентифицировали M. kumamotonense, M. scrofulaceum / M. avium, M. avium, M. flavescens / novocastrense, M. kumamotonense / hiberniae, M. lentiflavum, M. colombiense / M. avium и M. kumamotonense / terrae / hiberniae (1) каждый. Результаты секвенирования гена 16S рРНК и hsp65 были согласующимися в трех и несогласованными в пяти изолятах, не идентифицированных GenoType® Mycobacterium CM / AS.

Инфекции NTM могут играть жизненно важную роль в возникновении болезней легких и борьбе с туберкулезом в эндемических условиях. GenoType® Mycobacterium CM / AS представляет собой полезный инструмент для выявления клинических инфекций NTM. Однако секвенирование гена рРНК 16S следует рассматривать для подтверждения диагноза клинических изолятов. Из-за сложности и несогласованности идентификации NTM мы рекомендуем централизовать диагностику инфекций NTM путем укрепления и создания качественной национальной и региональной инфраструктуры.

За последние десятилетия распространенность легочных нетуберкулезных микобактерий (НТМ) все чаще сообщается во всем мире. Однако эпидемиологические и эпиднадзорные данные об инфекциях НТМ по-прежнему ограничены [1]. Определение эпидемиологии заболеваний NTM в большинстве беднейших ресурсов, таких как Танзания, является более сложным, чем его хорошо документированный относительный туберкулезный комплекс Mycobacterium tuberculosis (MTC) [2].

Из-за их повсеместного присутствия в окружающей среде воздействие НТМ, вероятно, является распространенным явлением, поскольку они могут колонизировать дыхательные пути, не вызывая заболевания, так что обнаружение НТМ в респираторных выделениях не обязательно имеет клинические последствия для всех пациентов [3-5]. Дифференцирование истинной инфекции легкого NTM от загрязнения и / или колонизации затруднено; следовательно, присутствие кислотоустойчивых бацилл (AFB), положительное с помощью микроскопии респираторного образца или культуры, представляет собой серьезную диагностическую задачу. Все чаще НТМ становятся признанными истинными патогенами и важными причинами человеческих инфекций [6, 7].

Информация о роли, вкладе и бременах НТМ в этиологии туберкулезных синдромов ограничена во многих странах Африки к югу от Сахары, эндемичных по туберкулезу и ВИЧ [8-10]. Отсутствие быстрых и точных методов диагностики положительных легочных инфекций AFB из-за NTM приводит к ошибочному диагнозу и неправильному управлению туберкулезом легких в таких условиях. Правильная и своевременная идентификация НТМ особенно актуальна как для терапии, так и для эпидемиологии, поскольку инфекции с различными микобактериальными видами требуют различных подходов к управлению [11, 12].

Танзания входит в число 22 стран с высоким бременем (HBC) в мире с высокой распространенностью туберкулеза. В среднем ежегодно регистрируется 61 500 новых больных туберкулезом [13]. Пациенты с положительной мокротой AFB или рентгенологические данные грудной клетки, предположительно активные ТБ, которые не реагируют на общие противомикробные препараты, обычно считаются положительными для ТБ. В качестве общего руководства пациенты подвергаются эмпирическому лечению противотуберкулезными препаратами первой линии в течение 6 месяцев.

Поскольку некоторые синдромы, подобные ТБ, также могут быть вызваны НТМ, неубедительная диагностика туберкулеза легких приведет к чрезмерной диагностике ТБ и, следовательно, к борьбе с инфекциями ТБ и НТМ.

Изобретение технологии ДНК-полосы (линейные пробные анализы) на основе обратной гибридизации продуктов ПЦР с их комплементарными олигонуклеотидными зондами произвело революцию в диагностике NTM. Наборы для анализа ДНК на основе ДНК GenoType® Mycobacterium CM / AS (Hain Life science GmbH, Нерен, Германия); GenoType® CM / AS для обнаружения общих и дополнительных видов NTM широко и успешно использовались в качестве быстрых молекулярных инструментов для диагностики NTM как в бедных ресурсах, так и в развитых странах. Однако сообщалось о перекрестной реактивности ДНК-зондов между микобактериальными видами, что приводило к неправильному диагнозу и лечению пациентов [14, 15]. Использование молекулярных методов, нацеленных на гены 16S рРНК и hsp65, было полезно при диагностике и видообразовании NTM, в том числе мертвых или нецелевых [16].

Таким образом, целью настоящего исследования было определение частоты и разнообразия НТМ среди подозреваемых в туберкулезе в северо-восточной Танзании с использованием обычных фенотипических методов, наборов GenoType® Mycobacterium CM / AS и 16S рРНК, а также секвенирования гена hsp65.

Наши результаты показывают, что инфекции NTM могут играть жизненно важную роль в возникновении болезней легких и, следовательно, влиять на управление туберкулезом в таких эндемичных условиях, как Танзания. Поэтому необходимость рассмотрения НТМ в программах борьбы с туберкулезом в таких условиях является актуальной.

Исследование проводилось в двух периферийных диагностических центрах (PDC) Нгамиани и Макороры. Центры служат в качестве основного водосбора для диагностики туберкулеза в муниципалитете Танга и двух больницах районной больницы Мухеза (MDDH) и больницы Бомбо. Танга входит в первую десятку регионов с высоким уведомлением о туберкулезе в Танзании, и ежегодные случаи уведомления о туберкулезе для всего региона составляют около 3852 случаев, а распространенность ТБ в 217/100 000 и 244/100 000 в городских и сельских районах соответственно в соответствии с национальным обследованием распространенности , 2012 [17].

Поперечное сечение было проведено в период с ноября 2012 года по январь 2013 года. В общей сложности 744 образца пятен и утренних мокроты были собраны у 372 больных с подозрением на туберкулез, которые были представлены в PDC и больницах. Были включены все пациенты, представившие диагностический центр с любым из следующих симптомов: наличие симптомов, указывающих на ТБ в течение 2 недель, ночные поты, усталость, неожиданную потерю веса и лихорадку. Три образца мокроты были собраны у пациентов (один на месте во время первого посещения, одно раннее утро и другое пятно на следующее утро). Ранний утренний спутук хранился при -20 ° C, а затем транспортировался в лабораторию Mycobacteriology в университетской клинике Лейпциг (Германия) для культивирования и молекулярной идентификации.

Микроскопия прямого мазка с использованием Ziehl Neelsen (ZN) или флуоресцентных пятен проводилась на соответствующих исследовательских объектах опытными лаборантами и результатами, записанными в соответствии с рекомендациями ВОЗ / МУТЛ и национальных программ борьбы с туберкулезом и проказами (NTLP) [18, 19].

В Лейпциге все образцы мокроты обрабатывались стандартным методом N-ацетил-L-цистеин (NALC) -NaOH [20]. Вкратце, 10 мл 0,5% раствора N-ацетилцистеина (NALC) добавляли к каждому образцу, образцы затем инкубировали при комнатной температуре на шейкере в течение 20 мин с последующим добавлением 30 мл фосфатно-буферного солевого раствора (PBS) pH 6,8 для нейтрализации и затем центрифугируют при 3000 × g в течение 20 мин. Отложения ресуспендировали в 1 мл PBS после отбрасывания супернатанта. Вся процедура дезактивации выполнялась в соответствии с рекомендациями Deutsches Institut für Normung (DIN) для выявления микобактерий [21].

Около 2-3 капель ресуспендированных образцов инокулировали на средах Lowenstein-Jensen (LJ), Gottsacker и Coletsos (Artelt-ENCLIT GmbH, Германия), дополненных антибиотиками (полимиксин B (200 000 МЕ / литр), амфотерицин B (10 мг / литр), карбенициллин (50 мг / л) и триметоприм (10 мг / л) (ПАКТ). Культуры инкубировали в течение 8 недель при 37 ° С и читали еженедельно.

Исследование и отчетность микроскопии мазка проводили с помощью флуоресцентной микроскопии. Затем 0,5 мл каждого образца инокулировали в бутылки BacT / Alert, дополненные антибиотиками PACT, и инкубировали в автоматизированной системе жидкой культуры BacT / Alert 3D (Biomérieux, Marcy l’Etoile, France) в течение 8 недель. Культура, не показывающая роста после 8 недель инкубации, считалась отрицательной. Положительные бутылки BacT / Alert были проверены на чистоту, покрывая каплю из каждой положительной бутылки на пластину агара крови (БА), чтобы исключить ложноположительные результаты из-за бактериального загрязнения, и одновременно было окрашено ZN, чтобы подтвердить наличие положительных результатов AFB.

Сланцы, содержащие чистые культуры AFB, оценивали на скорость роста и накопление пигмента на наклонах LJ, Gottsacker или Coletsos (при 30 ° C, 37 ° C и 45 ° C). Изоляты NTM были сгруппированы по классификации Runyon и были сопоставлены с результатами молекулярных методов.

Микобактериальную ДНК экстрагировали из инактивированных нагреванием изолятов AFB. Вкратце, бактерии, суспендированные в 500 мкл стерильной воды или 1 мл непосредственно из положительных бутылок BacT / Alert, инактивировались при 80 ° C в течение 20 минут, затем обрабатывались ультразвуком при 35 кГц и нагревались при 100 ° C в течение 10 минут каждой обработки и центрифугировались при 16 100 × г два раза в течение 5 мин. Супернатант принимали за матричную ДНК. Геномную ДНК штамма H37Rv и стерильную дистиллированную воду использовали в качестве положительного и отрицательного контроля соответственно для всех молекулярных процедур.

Все изоляты, идентифицированные как NTM, основанные на их культурных характеристиках и подтвержденные окрашиванием ZN, подвергались дальнейшей окончательной идентификации с использованием двух коммерческих наборов GenoType® Mycobacterium CM для обнаружения общего NTM. Изоляты, не идентифицированные с помощью анализа GenoType® CM, были дополнительно протестированы с помощью анализа GenoType® AS для дополнительного NTM. Все процедуры были выполнены в соответствии с инструкциями производителя.

Все изоляты, не идентифицированные по видовому уровню с помощью анализа CM / AS, анализировали с помощью секвенирования генов 16S рРНК и hsp65. Для анализа последовательности гена 16S рРНК проводили в соответствии с [22] с использованием праймеров 285 и 264 для получения ПЦР-продукта (1037 п.о.) и праймера 271 для секвенирования. Для секвенирования гена hsp65 ПЦР проводили в соответствии с [23] с использованием праймеров 21M13TB11 / M13TB12, генерирующих фрагмент длиной 441 пар оснований. Для секвенирования использовали праймер M13 / pUC вперёд. Праймеры были приобретены у Jena Bioscience, Йена, Германия. Продукты ПЦР очищали для секвенирования с использованием набора для очистки QIAquick PCR или, альтернативно, набора для экстракции геля QIAquick в соответствии с инструкциями производителя. Последовательность была выполнена компанией GATC (Констанц, Германия). Исходные данные были проанализированы в FLI с использованием программного обеспечения BLAST для Национального центра биотехнологической информации (NCBI), оптимизированного для высокоподобных последовательностей (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov). Идентификация деформации основывалась на хите BLAST с наивысшими показателями в сочетании с наибольшим охватом последовательности и идентичностью. В качестве ссылок для оценки подобия использовались ссылочные штаммы с наивысшим показателем сходства, присутствующим в базе данных NCBI.

Демографические и клинические данные были очищены и проанализированы пакетом SPSS версии 11.5 для Windows (SPSS Inc., Chicago, IL). Модель двоичной регрессии использовалась для анализа предикторов изоляции NTM. Односторонний анализ дисперсии (ANOVA) использовался для определения анализа тренда по заказанным группам. Значение Р <0,05 считалось статистически значимым. Результаты анализа GenoType® Mycobacterium CM / AS были интерпретированы на основе инструкций производителей.

Протокол для этого исследования был рассмотрен и одобрен Этическим комитетом Национального института медицинских исследований (NIMR), Дар-эс-Салам, Танзания. Письменное информированное согласие было получено от пациентов или родственников пациентов, где пациенты не могли читать и писать.

В общей сложности 744 образца мокроты были собраны у 372 больных туберкулезом, которые были представлены в двух PDC и двух больницах в Танге, на северо-востоке, в Танзании. Доля мужчин 196 (52,7%) была выше, чем у женщин 176 (47,3%). Медианный возраст пациентов составлял 40 лет (от 7 до 8 лет).

Демографические данные и факторы риска, связанные с инфекциями NTM, показаны в (Таблицы 1, 2). Общая частота пациентов с НТМ в исследовании составила 9,7%; Было обнаружено, что положительная активность ВИЧ связана с NTM-инфекцией среди проанализированных факторов со статистической значимостью (OR 3,86, 95% ДИ [1,79-8,3], P <0,001). Не было никакой связи между NTM и другими анализируемыми факторами. Табл. 1Демографические характеристики и лабораторные данные пациентов с инфекциями NTM, стратифицированными сайтом

Центр здоровья HC, MDDH Назначенная районная больница Muheza, MTBC
M. tuberculosis, NTM нетуберкулезная микобактерия

Факторы риска, связанные с инфекцией NTM среди подозреваемых больных туберкулезом, посещающих PDC / больницы на северо-востоке, в Танзании с ноября 2012 года по январь 2013 года

ИЛИ нечетное отношение, доверительный интервал CI

*
Значение P статистически значимо при P <0,05

Из 372 пациентов положительные культуры микобактерий были получены у 121 (32,5%) пациентов, и среди этих 36 (9,7%) пациентов был охвачен НТМ, которые являются предметом этой статьи. От каждого пациента были проанализированы три образца мокроты для роста NTM. В общей сложности 101 образец мокроты был положительным для NTM культурой. В связи с этим 29 пациентов (80,6%) были положительными для роста NTM во всех трех образцах, а семь пациентов (19,4%) были положительными для NTM только в двух из трех образцов. NTM без каких-либо других коинфекций было обнаружено у 21 (58,3%) пациентов. Коинфекция NTM с ВИЧ была обнаружена у 11 (30,6%) пациентов, у MTBC у трех (8,3%) пациентов и NTM с коинфекциями ВИЧ и MTBC у одного (2,8%) пациента. Один пациент был одновременно положительным для NTM плюс Nocardia spp. (данные не показаны) (таблица 3). Ни у одного из пациентов не было смешанных инфекций NTM. Таблица 3Комбильность NTM с M.tb и / или ВИЧ среди людей с НТМ

Из 121 пациента у 81 (66,9%) пациентов была положительная микроскопия мазка для AFB, а у 40 (33,1%) пациентов были отрицательные мазки в лаборатории в Лейпциге. С другой стороны, у тех 121 пациента с положительной культуральной активностью у 64 (52,9%) пациентов была положительная микроскопия мазка для AFB, а у 56 (46,3%) пациентов была микроскопия с отрицательным мазком для AFB в местных PDC / больницах, тогда как только одна (0,8 %) у пациента был положительный положительный ответ AFB в местных PDC / больницах, но в микроскопии и культуре с отрицательным мазком в Лейпциге.

Основываясь на их характеристиках роста и производстве пигментов, изоляты были сгруппированы в разные группы Runyon [24]. Восемнадцать изолятов были классифицированы как скотохромогенные (Runyon II), 13 как нефотохромогенные (III), 4 как фотохромные (Runyon I) и 1 как быстро растущие микобактерии (Runyon IV). Результаты были сопоставимы с молекулярным детектированием по результатам набора Хейна (таблица 4). Табл. 4Species распределения НТМ, выделенных из PDCs / больниц в северо-восточной Танзании на основе группировки Runyon и GenoType® Mycobacterium CM / AS

Результаты генотипирования с использованием GenoType® MTBC для MTC и GenoType® Mycobacterium CM / AS для изолятов NTM на каждом сайте показали, что распространенность только M. tuberculosis составляла 10,4, 22,7, 24,2 и 26,9% в Makorora HC, Ngamiani HC, Bombo RH и MDDH соответственно. Распространенность только НТМ составляла 10,4, 11,0, 1,6 и 8,2% в Макороре ХК, Нгамиани HC, Bombo RH и MDDH соответственно (таблица 1).

Идентификация изолятов NTM к видовому уровню с помощью наборов GenoType® Mycobacterium CM / AS была достигнута у 28 (77,8%) изолятов с GenoType® Mycobacterium CM, идентифицирующих 23 (63,9%) изолятов и GenoType® Mycobacterium AS, идентифицирующих 5 (13,9%) изолятов , С другой стороны, восемь (22,2%) из 36 изолятов не могли быть идентифицированы ни одним комплектом. M. gordonae и M. interjectum были наиболее часто идентифицированы с 6 (16,7%) изолятами, за которыми следуют M. intracellulare 4 (11,1%), M. scrofulaceum 3 (8,3%), M. avium spp. 2 (5,5%), M. fortuitum 2 (5,5%), M. kansasii 1 (2,8%), M. lentiflavum 1 (2,8%), M. simiae 1 (2,8%), M. celatum 1 (2,8%), и M. marinum 1 (2,8%) (таблица 4).

Восемь изолятов, которые ранее не были идентифицированы наборами GenoType® Mycobacterium CM / AS, были проанализированы секвенированием гена 16S рРНК и дополнительно секвенированием гена hsp65. Три из восьми видов дали сопоставимые результаты с обоими генами, в то время как пять анализов hsp65 дали результаты, отличные от секвенирования гена 16S рРНК.

Секвенирование гена 16S рРНК для восьми изолятов дало M. kumamotonense (n = 2), M. intracelullare / kansasii, M. intermedium / triplex, M. acapulcensis / favenscens, M. stomatepiae, M. colombiense и M. terrae complex (n = 1). Результаты с соответствующими длинами секвенированных фрагментов ДНК показаны в (Таблица 5). Виды таблеток 5NTM, идентифицированные на основе гена 16S рРНК и секвенирования гена hsp65

Хотя эпидемиология туберкулеза хорошо документирована, распространенность и эпидемиология НТМ в Танзании в значительной степени распущены [25]. Легочные инфекции NTM все чаще сообщаются из-за повышенного населения, подверженного риску из-за ВИЧ-инфекции, старости, других иммуносупрессивных состояний, повышения осведомленности и улучшения диагностических средств, особенно в развитых странах [26, 27].

В Танзании существующее предположение состоит в том, что большинство лиц, которые имеют легочные симптомы, отражающие микобактериальные заболевания, инфицированы MTC. Шансы на то, что НТМ пропущены во время диагностики, в значительной степени объясняются плохими диагностическими возможностями для культуры и идентификации НТМ, эндемического характера МТС, вскрыши от болезней, таких как малярия и ВИЧ. Кроме того, недостаточная информированность среди сотрудников общественного здравоохранения и отсутствие стандартизированных или принятых критериев для надлежащего определения и отчетности NTM привели к меньшему вниманию к инфекциям NTM.

В этом исследовании общая частота пациентов с НТМ, обнаруженных наборами Хейна среди пациентов с подозрением на туберкулез легких, составила 9,7%. Мы идентифицировали M. gordonae и M. interjectum с 6 (16,7%) изолятами, каждый из которых составлял около одной трети всех изолятов NTM, M. intracelullare 4 (11,1%), M. avium spp. и M. fortuitum 2 (5,5%), M. kansasii, M. lentiflavum, M. simiae, M. celatum, M. marinum 1 (2,8%) изолируют каждый. Кроме того, восемь изолятов, которые не дали сигнала с наборами GenoType® Mycobacterium CM / AS, были идентифицированы секвенированием гена рРНК 16S. Эти изоляты были отнесены к виду M. kumamotonense (2), M. intracellulare / kansaii (1), M. intermedium / M. триплекс (1), M. acapulcensis / M. flavescens (1), M. stomatepiae (1), M. colombiense (1) и M. terrae (1). Кроме того, секвенирование гена hsp65 проводили, если последовательности 16S рРНК не были дискриминационными, чтобы, в частности, подтвердить неоднозначные назначения видов. Однако только три из восьми изолятов оба гена указали один и тот же вид, для пяти изолятов были получены несогласованные результаты путем секвенирования обоих генов (таблица 5). Секвенирование различных генов, используемых для идентификации бактериальных видов, может привести к несовместимым результатам. Проблема еще сложнее с микобактериями, которые характеризуются межвидовым сходством, явно выше, чем у других бактерий [28, 29]. Эти результаты подчеркивают трудности идентификации видов для NTM. Поэтому очень важно стандартизировать методы для получения сопоставимых результатов между различными лабораториями, странами и континентами.

M. kumamotonense, M. acapulcensisM. новокастренсе, M. stomatepiae и M. hiberniae, определяемые либо 16S рРНК, либо hsp65 в этом исследовании (таблица 5), были зарегистрированы в других странах мира. Некоторые из них были связаны с заболеваниями человека и другими, выделенными из окружающей среды [30-33]. Насколько нам известно, эти виды ранее не сообщались в Танзании.

Наши результаты согласуются с результатами других исследований в Танзании и Африке, которые указывают на увеличение распространенности НТМ [9, 34, 35]. Существуют ли географические различия в разнообразии НТМ в Танзании, неясно, поскольку это исследование было сосредоточено только на пациентах, проживающих в более или менее сходном географическом расположении вдоль северо-восточного побережья Танзании.

Понимание распределения и клинического воздействия NTM имеет значение для общественного здравоохранения, поскольку оно касается проблем, связанных с более полной диагностикой туберкулеза и потенциалом лечения NTM-инфекций. Как сообщалось ранее [35], среди людей, скота и дикой природы существуют довольно разнообразные виды НТМ [36]; поэтому подчеркивается необходимость изучения распределения и клинического воздействия различных видов НТМ в Танзании.

Анализ предикторов инфекции NTM в этом исследовании показывает отсутствие связи между полом, возрастом, местом жительства и профессией у пациентов с диагнозом NTM. Тем не менее, необходимо изучать инфекции НТМ в эндемических условиях туберкулеза, таких как Танзания, через большую когорту, и оценка их воздействия на заболевание туберкулеза особенно актуальна. Хотя в настоящем исследовании мы не проводили тестирование на чувствительность к лекарственным средствам для изолированного НТМ, такие пациенты могут ошибочно считаться имеющими изоляты MDR.

Люди с иммунодефицитом, связанные с ВИЧ / СПИДом, подвергаются высокому риску заражения NTM, часто сообщаются M. intracellulare и M. avium complex (MAC) [37-39].

Результаты этого исследования показывают, что люди с ВИЧ-положительным статусом имели различный диапазон NTM-инфекций, а ВИЧ был важным предиктором обнаружения NTM (OR 3,86, 95% ДИ [1,79-8,3], p <0,001). В идентифицированный NTM включали M. scrofulaceum (2), M. avium spp. (2), M. gordonae (2), M. intracelullare (1), M. lentiflavum (1), M. celatum (1) и M. interjectum (1). Было обнаружено, что два изолята из ВИЧ-положительных случаев, не идентифицированные наборами Хейна, принадлежат M. kumamotonense и M. intracellulare секвенированием 16S рРНК.

MAC и редко идентифицированные виды M. lentiflavum и M. sherrisii были зарегистрированы среди ВИЧ-положительных пациентов с легочной болезнью в Замбии и Танзании [9, 34, 40]. M. sherrisii, который, как было установлено, обычно ассоциируется с ВИЧ-индивидуумами в северной Танзании [34], не был обнаружен в этой популяции пациентов. Известно, что M. celatum, обычно выделенный из образцов человеческого респираторного тракта, является патогенным для пациентов с ВИЧ, а иногда и пациентов, не страдающих иммунитетом [41], тогда как M. gordonae является общим загрязнителем водоснабжения, почвы, случайным жителем мокроты человека и желудка образцы промывания редко (например, СПИД), если они когда-либо участвуют в болезненных процессах [41].

Коинфекции NTM с заболеванием M. tuberculosis редко диагностируются из-за перекрывающихся клинических проявлений [10]. Наши результаты показывают, что у пяти (1,3%) индивидуумов были как M. tuberculosis, так и NTM, которые включали M. scrofulaceum (2), M. interjectum (1), M. gordonae (1) и один изолят, не идентифицированный наборами Hain, был идентифицирован как M. kumamotonense путем секвенирования 16S рРНК. Хотя можно предположить, что пациенты с такими сопутствующими инфекциями во многих случаях проявляют симптомы в основном из-за M. tuberculosis, роль таких сопутствующих инфекций подчеркивает необходимость дальнейших исследований для определения их вклада в патогенез болезни, тяжесть и прогрессирование.

НТМ представляют собой серьезную проблему для программ лечения туберкулеза, поскольку такие пациенты управляются в основном на основе микроскопии мазка, которая не подходит для дифференциации между МТС и НТМ, но и основные недостатки связаны с ограниченной чувствительностью и специфичностью симптомов и радиологии [8]. Культура, с другой стороны, является золотым стандартом, но требует много времени, требует использования различных типов носителей и более длительной инкубации для оптимизации роста. Так как такие сложные алгоритмы культуры недостаточны за пределами справочных центров, NTM требуют особого внимания как возможной причины заболевания.

Хотя мы не можем, конечно, заключить, что изолированное достоинство НТМ можно классифицировать как причину инфекции / заболевания в каждом конкретном случае, простое присутствие НТМ в конкретном случае может сделать решение по диагнозу более сложным. Потребность в просвещении в области общественной гигиены особенно высока, поскольку НТМ в основном встречаются в окружающей среде (вода, почва). Если люди будут обеспечивать лучшее управление гигиеной в своих домах и приготовление пищи, хранение животных, кипячение воды до выпивки и т. Д., Риск заражения будет снижаться, особенно для лиц с повышенным риском, таких как дети, пожилые люди и люди с ослабленным иммунитетом.

Ряд факторов мог бы ограничить наши результаты. Во-первых, отсутствие предварительных лабораторных данных о хронических пациентах ограничивало нас от определения, были ли они инфицированы только НТМ или у них прежде всего была коинфекция с M. tuberculosis. Во-вторых, отсутствие последующих ограничений ограничивает способность устанавливать результаты пациентов, особенно с заболеванием NTM, во многих неблагоприятных для ресурсов условиях. Более того, истинную распространенность НТМ можно оценить только посредством более широкого эпидемиологического исследования. Эти данные были сообщены Координационному комитету медицинских исследований, в котором представлена ​​Национальная программа борьбы с туберкулезом. Однако мы не уверены в том, что NTLP руководствуется началом соответствующего лечения NTM, поскольку нет четких национальных рекомендаций по управлению NTM. Это делает эти выводы очень важными, поскольку они могут служить базовыми данными для NTLP для разработки руководящих принципов управления NTM.

В заключение наши выводы показывают, что существует широкий спектр инфекций NTM, которые могут играть жизненно важную роль в возникновении болезней легких и влиять на лечение туберкулеза в эндемических условиях туберкулеза, приводя к ошибочному диагнозу и неправильному лечению случаев МЛУ, в частности клинически » «хронические случаи». Это подчеркивает необходимость рассмотрения НТМ при лечении пациентов с предполагаемыми неудачами лечения ТБ. Кроме того, необходима фундаментальная информация, которая отвечает диагностическим критериям ATS / IDSA для диагностики легочного NTM, чтобы улучшить понимание заболевания NTM. Существует острая необходимость в разработке стандартизированных критериев для определения и отчетности об инфекциях NTM. Мы рекомендуем централизовать лабораторную диагностику инфекций NTM путем укрепления и создания качественной национальной и региональной инфраструктуры.

ASH и BK участвовали в разработке исследования. ASH собрала образцы, провела эксперименты, провела анализ данных и подготовила рукопись, SGMM участвовала в анализе данных и доказала, что прочитала рукопись. ACR участвовал в проверке подлинности рукописи. IM выполнял анализ последовательности и корректуру рукописи. БК участвовал в проверке рукописи и координировал исследование. Все авторы прочитали и утвердили окончательную рукопись.

Мы хотели бы выразить нашу сердечную благодарность и признательность Региональному медицинскому сотруднику Танги, районным медицинским работникам, муниципальным и районным координаторам туберкулеза в Мухезе и Танге. Мы также благодарны всем медицинским работникам и лаборантам медицинских центров Нгамани и Макороры, районным больницам Бомбо и Мухеза, г-же Елизавете Крафтшек, Гесине Каут, доктору Йоргу Пиру за их техническую поддержку и г-же Тигест Алему за статистический анализ. Мы признаем г-жу Кэтрин Свини-Рид за редактирование рукописи. Это исследование было проведено при финансовой поддержке Института медицинской микробиологии и эпидемиологии инфекционных заболеваний, университетской больницы Лейпцига, Германии и Немецкой службы академических обменов (DAAD).

Авторы заявляют, что у них нет конкурирующих интересов.

Комментариев нет.

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *